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食品经营许可证的办理流程如下：

填写并提交食品经营许可证申请书。申请者需要详细填写相关信息，并确保内容的真实性和准确性。
准备并提交相关证明文件。这包括营业执照或者其他主体资格证明文件的复印件，需要核对原件。如果是委托他人办理，还需要提供授权委托书以及代理人的身份证复印件。
提供与食品经营相适应的主要设备设施布局、操作流程等文件。这些文件应详细描绘设备设施的布局和操作流程，以确保食品经营活动的合规性。
制定并提交保证食品安全的规章制度清单。这些规章制度应涵盖食品安全自查、从业人员健康管理、进货查验记录、食品安全事故处置等方面，以确保食品经营活动的安全性和合规性。
提交员工身份证双面复印件和健康证复印件。员工需要持有有效的健康证，以确保食品经营活动的卫生安全。